十倍体长穗偃麦草Ca^(2+)转运蛋白ThCAX1表达及生物信息学分析

摘要

CAX[Cation(Ca^(2+))/H^(+)exchanger]基因是重要的Ca^(2+)/H^(+)反向转运蛋白,负责细胞内Ca^(2+)浓度调节。为探讨十倍体长穗偃麦草(Thinopyrum ponticum,2 n=70)中ThCAX1编码基因的序列信息和蛋白结构,以十倍体长穗偃麦草与普通小麦品种百农AK 58远缘杂交后代5 ES易位系为研究材料,分析了ThCAX1序列信息、蛋白结构和互作网络。结果表明,ThCAX1基因全长编码序列1695 bp,编码565个氨基酸,蛋白分子量59.39 kDa;遗传进化分析表明,该基因来源于十倍体长穗偃麦草5 E染色体短臂;蛋白信息预测结果显示,该蛋白为亲水性跨膜蛋白,含5个跨膜结构域,无信号肽,为非分泌性蛋白;二级结构含有25个α螺旋(α-helix)、7个延伸链(extended strand)和26个无规卷曲(random coil);ThCAX1共有10个蛋白参与互作,其中6个蛋白参与离子交换。