Perl语言统计核酸GC含量程序开发

摘要

生命科学领域中无论是PCR还是测序,都需要了解目的核酸的GC含量.由于目前缺乏独立统计核酸GC含量的程序.该文采用Perl语言编程,设计处理了核酸序列统计GC含量的程序.程序采用了BioPerl环境,利用字符串拆分、遍历算法和正则表达式对核酸序列进行GC碱基的挖掘.最后该脚本可以应用于Windows和Linux系统.适合用于多环境.