2005年-2010年我国部分地区PRRSV流行毒株的遗传变异分析

摘要

为了掌握高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的变异情况,揭示该病的发生规律,根据GenBank登录的PRRSV基因序列设计引物,采用RT-PCR法对2005年-2010年间送检的282份病料进行了PRRSV核酸检测,对其中9份阳性样品进行了ORF5～7基因片段扩增和测序,所得序列与GenBank下栽的PRRSV CH-la、VR2332、HB-2、LV株的ORF5序列进行同源性比较,并与国内已发表的27株PRRSV ORF5序列进行遗传进化树分析,对GP5蛋白潜在糖基化位点和数目进行预测与分析.结果表明,病料PRRSV核酸阳性检出率为18.8%(53/282);9个流行毒株同属于一个基因亚群,其ORF5序列同源性为95.0%～99.2%,氨基酸序列同源性为92.0%～99.0%;与4个参考毒株的ORF5序列同源性依次为93.4%～95.5%、87.6%～89.4%、91.2%～92.7%和63.0%～64.0%,氨基酸序列的同源性依次为91.0%～94.0%、85.6%～88.6%、89.6%～92.0%和54.7%～58.2%;GP5糖基化位点分析表明,5个糖基化位点有3株,4个糖基化位点有5株,3个糖基化位点有1株;这些糖基化位点分布在第30位～第55位氨基酸之间,以第44、55位点保守,另3个位点存在变异.我国猪群中PRRSV流行毒株变异幅度较大,GP5糖基化位点不同可能与毒力存在一定联系.