青岛文昌鱼遗传多样性的RAPD分析

摘要

采用RAPD技术对青岛文昌鱼雌、雄各11条个体共22个样本进行遗传多样性检测.从40个寡聚核苷酸随机引物中筛选出17个扩增重复性好、条带清晰、特异性强的引物,对每个个体基因组DNA进行了扩增.得到RAPD产物的分子量在200～2 200 bp之间,产物总计127个位点,其中,多态位点60个(占47.24%).计算个体间遗传相似系数平均为0.865 6,个体间遗传距离平均为0.134 4.用Shannon多样性指数量化的遗传多态度(H0),雄性群体(0.191 2)高于雌性群体(0.112 5),平均遗传多态度(Hpop)为0.151 9.文昌鱼遗传多态度所占的比例在群体内为0.255 3,而雌、雄群体间为0.744 7.在文昌鱼雌、雄个体RAPD产物中,两个电泳图谱上能读出明显的雄性特征带,估计可能与雄性文昌鱼具有异型性染色体有关,这与XY型性别决定机制相吻合.引物OPC12扩增产物250 bp为雄性文昌鱼所特有,可能为区别性别的分子标记.用NJ法进行聚类分析,结果表明,22个个体明显按性别聚成两类,文昌鱼雌、雄个体基因组间的差异较大.