构建和验证铜死亡相关lncRNA风险模型预测胃腺癌的预后

摘要

背景:铜死亡是一种新的程序性细胞死亡方式,且被报道在肿瘤中起作用。越来越多的研究表明,长链非编码RNA (lncRNA)在胃腺癌(Stomach adenocarcinoma, STAD)的发生和发展中起重要作用。然而,铜死亡相关lncRNA在胃腺癌中的作用和预后价值仍然未知。目的:构建并验证铜死亡相关lncRNA风险模型来预测STAD患者的预后。方法:从The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库下载了STAD的转录谱和临床信息。然后通过共表达网络、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)算法以及COX回归模型构建了8个铜死亡相关lncRNA预后模型,并将患者分为高风险组和低风险组。此外,通过综合方法评估模型的预测能力。然后,构建了一个列线图来预测STAD患者的预后。通过GO、KEGG分析研究了高低风险组患者之间差异表达基因的生物学功能。使用免疫相关功能分析及肿瘤突变负荷(TMB)来研究高低风险组之间的免疫功能的差异。结果:构建了一个由8个铜死亡相关lncRNA组成的风险模型来预测STAD患者的预后。与低风险组STAD患者相比,高风险组的患者总生存期较短(P < 0.001)。ROC曲线分析验证了模型的有效性。与其他临床特征相比,铜死亡相关的lncRNA模型对患者预后的预测更为准确。GO和KEGG富集分析表明,高低风险组之间差异表达的基因与代谢高度相关。此外,高风险与低TMB的叠加会导致STAD患者的生存期进一步缩短。结论:8个与铜死亡相关的lncRNA构建的风险模型有助于评估STAD患者的预后。