基于RNA-seq技术研究地榆皂苷Ⅰ保护小鼠造血干细胞的转录组学特征

摘要

目的:研究地榆皂苷Ⅰ对骨髓抑制小鼠造血干细胞转录组学的影响.方法:45只C57BL/6小鼠按体重随机分为正常对照组、模型对照组与地榆皂苷Ⅰ 20 mg/kg组.小鼠腹腔注射环磷酰胺120 mg/kg建立骨髓抑制模型,造模当天开始灌胃给药,每天1次,连续5d.末次给药后4h,各实验组小鼠眼眶取血测定白细胞和中性粒细胞数量;剖取股骨后分离骨髓造血干细胞,测定骨髓DNA和造血干细胞数量后提取造血干细胞总RNA进行测序,检测各组造血干细胞基因表达情况,再将数据进行基因表达丰度分析、GO富集分析及KEGG通路富集等分析.结果:地榆皂苷Ⅰ 20 mg/kg灌胃可明显升高骨髓抑制小鼠外周血白细胞和中性粒细胞数量(P＜0.05),同时可明显升高骨髓DNA和造血干细胞数量(P＜0.05);三个实验组小鼠骨髓造血干细胞共有126个差异基因,其中与造血干细胞相关差异表达基因有26个,且差异基因之间的表达具有显著相关性.通过GO和KEGG富集分析发现,与造血干细胞有关的差异表达基因主要富集在细胞因子受体相互作用、IL-17、TNF等信号通路,其中,Cxcr、Cxcl等趋化因子家族成员在这些信号通路上高频出现.结论:地榆皂苷Ⅰ可能通过调控趋化因子介导细胞因子受体、IL-17、TNF等信号通路升高骨髓抑制小鼠造血干细胞和白细胞数量.