海洋球石藻(Emiliania huxleyi)病毒硫氧还蛋白(TRX)基因的克隆及生物信息学分析

摘要

首次从海洋球石藻病毒(Emiliania huxleyi virus-EhV 9981)中克隆了硫氧还蛋白(Trx)基因(该序列已提交GenBank,登录号:GU109280).系统进化关系分析表明:EhV99B1-Trx与GenBank中已报道的EhV86-Trx(NC 007346)有很高的同源性,核酸及其推导的氨基酸序列的同源性分别为98%和100%,而与其它物种的Trx序列同源性仅为9.8%-18.8%.采用生物信息学方法和工具分析了EhV9981-Trx的生化参数,预测了该蛋白的高级结构.结果表明:(1)EhV9981-Trx基因的开放阅读框全长591bp,编码196个氨基酸,蛋白的相对分子量为22.1kDa,理论等电点为5.27;(2)EhV-99B1-Trx N端蛋白结构域具有保守的Cys-Gly-Pro-Cys(CGPC)硫氧还蛋白氧化还原活性位点氨基酸基序;(3)对该蛋白二、三级结构分析预测结果进一步证实EhV9981-Trx基因编码的为一种新型的硫氧还蛋白家族成员.