线虫中影响化学传感器结构与功能的遗传位点及其可能对应的 microRNA的生物信息学分析(英文)

摘要

目的为了系统评价microRNA(miRNA)在调控化学传感器结构和功能方面的重要作用,我们进行了线虫中有关影响化学传感器结构与功能的遗传位点以及和其可能对应的miRNA的生物信息学分析。方法我们选择了55个与化学传感器结构与功能相关的遗传位点,并且进一步通过评价序列比对后的E值等手段来分析和确认其可能对应的miRNA。结果在55个遗传位点中,我们发现其中30个遗传位点存在与其可能对应的miRNA。这些所鉴定的基因在功能上几乎涵盖了化学传感器结构和功能调控的诸多方面。而且,我们的数据还表明化学传感器结构和功能可能受到一系列网状交联的上游信号通路所调节。另外,对应miRNA在这30个基因的3'端非编码区上的分布也呈现出各自特有的模式。结论我们勾勒出了可能存在的由miRNA介导的通过控制相应感觉神经元与中间神经元功能从而调控化学趋向性与温度趋向性的信号通路。本研究将有助于我们更好的了解线虫中可能由miRNA调控的化学趋向性和温度趋向性行为。