胃癌组织及转移组织中DNA甲基化差异的研究

摘要

目的研究胃癌原发灶和转移淋巴结组织间基因组DNA甲基化程度的差异以及寻找胃癌淋巴转移抑制基因.方法应用甲基化CpG岛扩增(MCA)方法富集甲基化的基因组DNA序列,以转移淋巴结MCA产物为检测子,原发灶MCA产物为驱赶子,进行代表性差异显示分析(RDA).将获得的甲基化差异片段克隆、测序,获得碱基序列,用生物信息学进行分析.结果获得19个差异序列,分布于5′端,外显子,内含子及3′端.其中KL59位于9p21,为p16基因的第一外显子内;KL22位于PTPRG基因启动子区.以KL22作探针与驱赶子、检测子及3轮RDA产物杂交,除驱赶子外都有杂交信号.结论胃癌原发灶与转移淋巴结组织间DNA甲基化存在差异,MCA-RDA方法为一种较好的分析方法.