基于ITS2序列的清风藤属药用植物分类鉴定研究

摘要

目的 探讨核基因内部转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列在清风藤属(Sabia)药用植物中的分类鉴定可行性与系统关系.方法 对9种38个产地的清风藤属药用植物ITS2序列进行PCR扩增和测序.基于(Kimura 2-parameter)K2P计算遗传距离,分析种内和种间变异与鉴定效率,应用最大似然法(maximum likelihood,ML)构建系统发育树.结果 清风藤属药用植物ITS2序列长度均为241 bp,GC含量为51.9-64.7％.38个产地清风藤属药用植物ITS2序列,共具有保守位点168个,变异位点数目为73个,简约信息位点数目为65个.ITS2在清风藤属药用植物中的种内变异为0-0.074,种间变异为0.007-0.205,种间变异较小,种间遗传距离与种内遗传距离存在交叉,没有形成明显的间隔.ML系统树表明,属内种间具有较高的自展支持率,基本能单独聚成一支,可对清风藤属药用植物种间进行有效分类鉴定.结论 ITS2序列在清风藤属植物中具有较好的通用性与鉴定效率,可用于清风藤属DNA条形码与分类鉴定研究.本研究为清风藤属植物的分类鉴定与系统演化研究提供了一定参考.