新基因LRP15的功能预测及其编码蛋白定位

摘要

目的:确定白血病复发相关新基因LRP15编码蛋白的亚细胞定位,利用生物信息学探索网上预测基因功能的新方法.方法:以人类基因组资源(HGR)数据库为基础,进行LRP15启动子区特征分析.在Prosite数据库中进行有生物学意义的保守性氨基酸修饰位点搜索.通过RPS-BLAST程序预测其蛋白质结构及功能.以增强绿色荧光蛋白(EGFP)为报告基因,利用激光共聚焦显微镜等实验方法验证生物信息学的分析结果.结果:LRP15编码蛋白含有 cAMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点及酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,其N端有一个富含亮氨酸重复序列,定位于细胞核内.结论:生物信息学是预测基因功能的有效方法;利用EGFP可以将LRP15蛋白定位于细胞核内;LRP15基因可能是一个参与细胞发育调控的新基因.