小龙虾肠道细菌群落多样性及产蛋白酶细菌的筛选

摘要

[背景]养殖动物对饲料的消化利用往往与肠道菌群密切相关.[目的]揭示小龙虾肠道细菌群落组成,并从小龙虾肠道筛选产蛋白酶细菌.[方法]在Illumina MiSeq PE300平台对细菌16S rRNA基因V3-V4区进行高通量测序,分析小龙虾肠道细菌群落多样性;通过酪蛋白平板法筛选产蛋白酶细菌并进行分子生物学鉴定.[结果]小龙虾肠道细菌优势门包括变形菌门、软壁菌门、厚壁菌门、拟杆菌门等4个门,累计占比为98.53％;优势属包括柠檬酸杆菌属、支原体科Candidatus_Bacilloplasma暂定属、哈夫尼菌属、肠球菌属、拟杆菌属、梭菌科未分类属、希瓦氏菌属等7个属,累计占比为91.67％.通过酪蛋白平板法筛选的产蛋白酶细菌来自哈夫尼菌属、柠檬酸杆菌属、克雷伯氏菌属和芽孢杆菌属.[结论]小龙虾肠道细菌核心类群在蛋白质消化利用中发挥了重要作用.