基于TCGA数据库探讨胃癌组织中miR-96、BDNF表达变化和临床病理意义

摘要

目的观察胃癌组织中微小RNA-96(miR-96)、脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)mRNA表达变化,并探讨其临床病理意义。方法从包含TCGA数据网站下载胃癌患者数据集,按照miR-96表达水平由高到低排序,将排在前50%的患者设为高表达组(n=181),其余设为低表达组(n=181),并比较2组患者生存曲线。将数据集中包含的所有mRNA表达水平逐一与miR-96表达水平进行Pearson相关性检验,根据相关系数选取与miR-96表达水平相关性最高的基因。收集经手术切除、病理证实的80例胃癌组织及相应的癌周组织,检测组织中miR-96、BDNF mRNA表达水平,并观察其在胃癌组织和癌周组织中的表达情况,及其与患者年龄、性别、肿瘤直径、分化程度、淋巴结转移、TNM分期和Luaren分型的关系,并分析二者的相关性。结果miR-96高表达组中位生存时间高于miR-96低表达(P<0.05);miR-96与BDNF mRNA表达相关性最高。miR-96 mRNA在胃癌组织中表达量明显低于癌周组织,BDNF mRNA在胃癌组织中表达量明显高于癌周组织(P<0.05)。miR-96低表达、BDNF高表达与肿瘤分化程度、淋巴结转移、TNM分期及Luaren分型有关(P<0.05,P<0.01)。胃癌组织中miR-96、BDNF mRNA表达呈显著负相关(r=-0.342,P<0.01)。结论miR-96低表达、BDNF高表达与胃癌的发生、侵袭转移及恶性程度增加有关,miR-96可能通过靶向调控BDNF来抑制胃癌进展。