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趋化因子受体4与胃癌患者预后的相关性及潜在机制探索

     

摘要

目的探讨趋化因子受体4(CXCR4)对胃癌患者预后相关性及潜在机制。方法从TCGA数据库下载胃癌患者的RNA表达及临床数据,按CXCR4表达水平分为高表达组(188例)和低表达组(187例),比较2组患者生存时间、不同肿瘤分期胃癌患者的CXCR4表达水平;将患者所测的各个RNA表达水平逐一与CXCR4表达水平进行Pearson相关性分析,选取相关性最高的前50个基因;对筛选出的50个基因进行GO富集分析、KEGG通路富集分析以及所编码的蛋白质之间的相互作用。结果CXCR4高表达组胃癌患者中位生存时间低于CXCR4低表达组(P0.05)。在检测的20225个基因中,有11623个基因与CXCR4存在相关性,选取与CXCR4表达相关系数最高的前50个基因,其中氢电压门控通道1和RCSD结构域1与CXCR4表达水平的相关系数最高(r=0.749、0.738,P<0.001)。GO富集分析可见,主要涉及的生物学过程包括对刺激的反应、生物调节、细胞通讯,主要定位的细胞组分为膜、囊泡、细胞质,主要涉及的分子功能为蛋白质结合、分子换能器活动、酶调节剂活性。KEGG通路富集分析可见,主要涉及的信号通路为负性胸腺T细胞选择、B细胞活化参与免疫反应、免疫球蛋白介导的免疫反应;编码蛋白之间的相互作用网络可见,酪氨酸蛋白激酶BTK、胞质分裂蛋白2脱除剂、受体型酪氨酸蛋白磷酸酶C是处于网络核心的蛋白。结论CXCR4高表达与胃癌患者远期生存率降低及肿瘤分级更高相关,这可能与其通过调控免疫系统而促进肿瘤细胞免疫逃逸有关。

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