基于TCGA数据集分析脑胶质瘤中TEFM基因mRNA的表达及意义

摘要

目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据集分析人脑胶质瘤中线粒体转录延伸因子(TEFM)基因mRNA的表达及其临床意义。方法基因表达谱动态分析(GEPIA)207例非肿瘤脑组织和518例脑胶质瘤组织中TEFM基因mRNA的表达差异。分析518例脑胶质瘤患者的TEFM基因mRNA表达量与临床病理参数和患者预后的相关性,探讨影响脑胶质瘤患者预后的因素。分析脑胶质瘤中TEFM基因与其他线粒体转录调控基因mRNA表达水平的相关性。结果与非肿瘤脑组织相比,人脑胶质瘤组织中TEFM基因mRNA表达水平显著升高(P<0.05)。脑胶质瘤中TEFM基因mRNA表达量与患者年龄、WHO分级、病理类型、头痛史与幕上定位具有显著相关性(P<0.05); TEFM mRNA表达量与脑胶质瘤患者的总体生存率相关性显著(P<0.05)。脑胶质瘤患者年龄、WHO分级、病理类型与幕上定位是影响患者预后的独立因素(P<0.05)。脑胶质瘤中TEFM基因的表达水平与TFAM、TFB1M、TFB2M、MTERF1～4、NRF1基因的表达水平呈显著正相关性(均P<0.01,R=0.59、0.51、0.68、0.70、0.36、0.51、0.51、0.48),与POLRMT基因的表达水平呈显著负相关性(P<0.01,R=-0.18)。结论 TEFM基因mRNA表达量在人脑胶质瘤组织比非肿瘤脑组织中显著升高,且和病理特征具有良好相关性,其表达可能具有预测脑胶质瘤进展和预后的价值。