10个半滑舌鳎家系MHC ⅡB基因多态性初步研究

摘要

为检测10个半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)家系MHC Ⅱ B(Cyse-DAB)基因的多态性水平、MHC Ⅱ类B位点数目以及平衡选择的作用,作者利用多聚酶链式反应(PCR)和直接测序的方法对10个半滑舌鳎家系MHCⅡB基因位点遗传变异和平衡选择进行了研究.用特异性引物和PCR扩增的半滑舌鳎MHC Ⅱ B基因片段大约397 bp,包含一部分第一外显子,全部第一内含子和全部第二外显子.10个半滑舌鳎家系中,每家系选取5个体,每个体5个克隆序列分析发现60个不同序列,代表60个等位基因,其中有28个是新发现的,已提交到GenBank.同源分析表明60个等位基因相似性为89.36％.共50个个体中,有6个存在5个不同等位基因,表明在半滑舌鳎至少存在3个座位.有9个家系的MHCⅡB序列多肽结合区(PBR)的非同义替换(dN)显著高于同义替换(ds).