一株石油降解菌Aquabacterium olei NBRC 110486的基因组完成图及分析

摘要

Aquabacterium olei RBRC 110486是一种新发现的具有降解石油能力的革兰氏阴性菌.为进一步探究该菌株降解石油的分子机制,挖掘菌株可能存在的生物功能,本研究使用PacBio高通量测序技术对其进行全基因组测序,基于完成图进行基因预测、功能注释以及次级代谢产物合成基因簇预测.该菌株基因组大小为3890087 bp,GC含量为67.33％,共3402个蛋白;另外发现大小为366221 bp的环形质粒pTB101,GC含量为66.91％,325个蛋白.共预测到2个可能的次级代谢产物合成基因簇.定位了该菌株的石油降解关键酶链烷1-单加氧酶AlkB,与假单胞菌属聚类在同一个分支.该基因组是Aquabacterium属的首个报道的序列完成图,已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库,登录号分别为CP029210和CP029211.以上研究将为菌株NBRC 110486的功能基因组学及石油降解特性研究提供基础数据.