藜麦RBOH基因家族的鉴定及表达模式分析

摘要

为了探索藜麦RBOH基因(CqRBOH)的结构特征,分析CqRBOH基因功能和表达模式,基于藜麦全基因组数据,通过生物信息学的方法对CqRBOH基因进行鉴定分析。鉴定出9个CqRBOH基因家族成员,根据染色体上位置将其命名为:[STBX]CqRBOH1—CqRBOH9;亚细胞定位预测结果表明,9个CqRBOH蛋白均定位于质膜上;基于系统进化树将CqRBOH基因家族分为4个亚家族,CqRBOH蛋白序列具有高度保守性,均含有NADPH氧化酶结构域(NADPH-Ox)等4个功能结构域;CqRBOH基因启动子区具有多种与非生物胁迫响应、激素响应以及与生长发育有关的顺式作用元件;转录组数据分析表明[STBX]CqRBOH3和CqRBOH5在藜麦幼苗中显著表达,部分CqRBOH基因响应干旱、高温和盐胁迫,这些结果为藜麦抗逆机制研究奠定了基础。