基因组原位杂交鉴定牛筋草AA基因组在穇子染色体上的分布及探针长度优化方法

摘要

采用基因组原位杂交(Genomic in situ hybridization,GISH)方法研究了牛筋草(Eleusine indica) AA基因组在穇子(E.coracana)染色体上的分布,并探讨了AA、BB基因组的同源关系.用超声波破碎法进行预剪切,以缺口平移法标记的牛筋草总DNA为探针,BB基因组的E.floccifolia (Forssk.) Spreng.总DNA为封阻,与AABB基因组穇子的中期染色体进行杂交.结果表明,牛筋草AA基因组分布在穇子的18条染色体上.不加封阻或加过量封阻均不能鉴别AA基因组,说明AA和BB基因组间的分化程度不大,双方共享的重复序列较多.牛筋草与E.floccifdia总DNA分别用超声波破碎2min和3min后,可得到峰值为300～750 bp的DNA片段,这说明不同物种的超声波破碎时间需要调整,以获得合适长度的探针.