FtsZ靶向多肽抑制剂的分子对接、分子动力学分析及抗菌活性评价

摘要

为了得到靶向FtsZ的潜在肽类抑制剂和对其作用机制进行探究,采用分子对接方法筛选靶向金黄色葡萄球菌FtsZ蛋白的肽类化合物配体,利用分子动力学方法分析筛选到的配体与FtsZ蛋白结合状态的动态变化,计算配体重原子位置均方根偏差(RMSD)和相互作用能(Interaction energy)。在分子动力学分析基础上,分析以上短肽配体的抗菌活性,测定其对GTP酶活性的影响。结果表明,TE101、PE101、PE102、PE103和PE104五个多肽对于金黄色葡萄球菌的生长有抑制作用,且该作用与FtsZ蛋白GTPase活性无关。