鼻咽癌颈淋巴结转移相关甲基化基因的筛选

摘要

【目的】分析鼻咽癌全基因组基因甲基化状态,筛选鼻咽癌颈淋巴结转移相关的甲基化基因。【方法】收集I期(T1N0M0)鼻咽癌石蜡标本及有颈部淋巴结转移的鼻咽癌组织标本(T1-4N1-3M0)各4例,分别提取DNA,富集两组样品基因组甲基化片段后采用甲基化芯片对两组标本进行高通量测序分析,对杂交信号进行扫描及初步数据处理,分析并筛选出两组标本的差异甲基化基因。【结果】Nimble Scan v2.5软件比较分析两组标本数据显示33个基因甲基化具有差异性,提示此33个基因可能为有颈部淋巴结转移鼻咽癌患者的甲基化基因谱。【结论】初步筛选鼻咽癌颈部淋巴结转移相关的33个甲基化基因,而DNA甲基化芯片是筛选异常甲基化基因的有效方法。