A73基因的克隆及其编码区序列分析

摘要

目的克隆Epstein-Barr(EB)病毒A73基因,并分析其编码区序列变异情况,为进一步研究其生物学功能提供基础.方法从7例鼻咽癌组织中分别提取其总RNA,以RT-PCR扩增A73基因编码序列,将其克隆入pGEM-T-Easy载体进行测序,以Blast软件在Genbank数据库中对其进行序列分析.结果成功克隆了高发区鼻咽癌的A73基因,序列分析表明该基因编码序列第45 nt发生A→C的碱基替换,该变异位于第VB外显子的157154nt,未引起相应第15位氨基酸的替换(CCA→CCC,P→P),其变异频率为7/7.结论高发区鼻咽癌EB病毒A73基因的编码序列存在变异,该变异属于鼻咽癌相关的多态性,有可能参与EB病毒某亚型的构成.