黑麦重复家族成员pAW161(348 bp)的DNA序列分析

摘要

黑麦亚端部特异序列pAW161是黑麦350～480 bp重复家族的一个成员.通过pAW161设计的特异引物获得的PCR扩增片段,已成功用于小麦外源转移材料的鉴定.在本研究中,用该引物从供试的分属4个种共7份黑麦材料中都扩增出一条清楚明亮的特异带纹,分别对扩增片段回收、克隆、测序.结果表明,它们的长度都为348bp,该序列简称为pAW161(348bp).不同黑麦比较发现,该序列高度保守,同源性达到99.39%,可作为黑麦的亚端部特异序列pAW161的分子标记.该序列存在着6个SNP位点,都位于此序列的3'端的156bp序列中,而5'端的192 bp的序列无变异;SNP变化在供试材料中不存在物种特异性.从结构上看,pAW161(348 bp)是重复家族pSc200的380 bp基本重复单元的两个头-尾串联重复序列的中间一段.