亚麻荠CsLEC1基因家族的鉴定及其在种子发育时期的表达分析

摘要

Leafy Cotyledon 1(LEC1)是参与植物种子胚胎发育和种子油脂合成调控的重要转录因子,为探究LEC1在亚麻荠中的结构和功能,从亚麻荠基因组数据库中鉴定得到CsLEC1基因家族,并对其进行生物信息学分析和差异表达分析.结果 发现,亚麻荠基因组中共有3个LEC1基因,分别命名为CsLEC1-1、CsLEC1-2和CsLEC1-3,编码239～ 241个氨基酸,分子质量为25.89 ～26.10 ku,定位于细胞核中,且属于酸性亲水性蛋白,无信号肽和跨膜结构域,说明为非分泌型蛋白.蛋白结构分析表明,CsLEC1蛋白的二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,均含有“α1-L1-Asp-α2-L2-α3”典型的HAP3亚基的B保守结构域.系统进化显示,CsLEC1蛋白与同为十字花科的拟南芥AtLEC1蛋白、甘蓝型油菜BnLEC1聚为一族.种子不同发育时期的差异表达分析显示,3个CsLEC1基因均在开花后20 d的种子中表达量最高.研究结果可为进一步解析亚麻荠CsLEC1基因及其编码蛋白的精准功能提供重要的科学参考.