葡萄VvWRKY70基因生物信息学及表达特性分析

摘要

WRKY是植物特有的转录因子,在多种生物和非生物胁迫中发挥作用。基于RNA-seq技术,课题组前期研究发现,SO_(2)熏蒸结合低温保鲜过程中多个功能未知的葡萄WRKY基因差异表达。经氨基酸序列同源性比对,研究选择与AtWRKY70氨基酸序列相似度最高的VvWRKY70进行生物信息学及表达特性分析。生物信息学分析结果表明,VvWRKY70基因启动子区含有W-box元件及茉莉酸甲酯、水杨酸等激素响应元件;编码蛋白由322个氨基酸组成,分子质量约36.57 ku,属亲水性蛋白;该蛋白丝/苏氨酸含量丰富;二级结构主要由无规卷曲和α-螺旋组成,N端含有高度保守的WRKY结构域,C端为C_(2)HC型锌指结构,属WRKY第Ⅲ亚家族;预测显示,其主要定位于细胞核中,且在进化上较为保守。qRT-PCR分析表明,VvWRKY70在玫瑰香葡萄根、茎、叶、花蕾、果中均有表达;葡萄果实VvWRKY70受SO_(2)和灰霉菌诱导上调表达,低温处理组下调表达。综上可见,VvWRKY70可能作为转录因子参与调节植株生理和果实发育过程,并在葡萄果实采后SO_(2)保鲜过程中发挥作用,调节果实贮藏期间的生物和非生物胁迫应答。