多管藻藻红蛋白生色团的理论计算

摘要

采用密度泛函B3LYP/6-31G(d,p)对多管藻(1LIA)藻红蛋白中的一对(αβ)亚基中的5种生色团进行了固定骨架优化,采用含时密度泛函TD-B3LYP/6-31G(d,p)对优化后的结构进行紫外-可见(UV-Vis)光谱的计算。结果表明,藻红胆素的电子转移均为从结构的一边流向另一边,而藻尿胆素的电子绝大多数是从结构的两边转移到中间,推测这两种特殊的电子转移方式决定了藻红胆素要比藻尿胆素更容易吸收光。通过对结果的分析,推测出光能的可能传播途径由α亚基传播到β亚基上,具体路径为:α140a(A)→α84(A)→β84(B)β50/β61(E)β155(B)