肝癌细胞周期调控相关基因预后模型构建与评估

摘要

目的 基于细胞周期调控相关基因构建新的肝癌预后模型,为预测肝癌的预后及肿瘤治疗提供新的思路和方向。方法 肝癌病人的mRNA表达谱和临床数据收集于TCGA肿瘤数据库、GEO基因表达数据库和ICGC肿瘤基因数据库。通过R软件分析筛选肝癌的差异表达基因,并通过通路与基因功能富集(PPEA)方法确定与细胞周期相关的基因集。使用单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier曲线联合确定与肝癌预后相关的细胞周期调控基因,使用Lasso Cox回归模型构建和验证肝癌预后模型。最后使用3对临床样本进行二代测序验证基因表达水平。结果 通过差异筛选和基因富集分析以及单因素Cox回归分析,找到24个细胞周期调控基因与肝癌病人预后相关(HR>1,FDR1,P<0.001)。临床样本测序结果验证显示,大部分肝癌细胞周期调控预后基因在肝癌组织中存在显著高表达。结论 本研究构建了细胞周期调控相关基因的肝癌病人预后模型,为肝癌病人的预后预测和治疗提供新的思路和分子治疗靶点。