一株伯克氏菌中两个阿魏酸酯酶的比较分析

摘要

本文从NCBI数据库中检索得到Burkholderia phytofirmansPsJN的两个阿魏酸酯酶基因序列,分别标记为Bpfae1和Bpfae2,运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,Bpfae1的基因全长为1671bp,该基因编码的氨基酸为556aa,此蛋白质的等电点为8.33,分子量为59978.22Da。Bpfae2的基因全长为1734bp,该基因编码的氨基酸为577aa,此蛋白质的等电点5.42,分子量为59339.25Da。序列比对结果表明,Bpfae1与Burkholderia xenovorans同源性最高为90%。Bpfae2与Burkholderiaglumae同源性最高为83%,这两个阿魏酸酯酶蛋白的同源率为29%。另外对这两个阿魏酸酯酶的立体结构进行了同源模拟。