糖尿病肾病肾关键基因的分析鉴定

摘要

目的利用生物信息学技术分析参与糖尿病肾病（DN）的关键基因及其有关的信号通路。方法从GEO数据库下载有关DN肾小球组织与正常人肾小球组织的所有基因,利用limma软件包筛选出两者的差异表达基因（DEG）,并对DEG进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络筛选出与DN相关的候选基因,通过候选基因与临床指标的相关性分析获得与DN密切相关的关键基因。结果通过GEO数据库筛选出52个DN肾小球组织与正常人肾小球组织的DEG。GO功能和KEGG通路富集分析显示,DEG主要参与细胞外结构组织、细胞外基质、细胞外基质结构组成成分以及补体和凝血级联反应等过程。经PPI网络分析筛选出14个与DN紧密相关的候选基因,经Pearson相关性分析确定了与DN患者临床指标具有显著相关性的11个关键基因（C3、CCL19、COL1A2、COL6A3、COL15A1、LOX、LUM、SERPINF1、TGFBI、THBS2、VCAN）。结论通过生物信息学分析筛选出了与DN患者临床指标密切相关的11个关键基因,为阐明DN的分子机制以及潜在治疗靶点提供了新的思路。