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miR-106b-5p在调节内皮细胞基因表达谱中的作用

             

摘要

目的:评估miR-106b-5p对内皮细胞基因表达谱的影响。方法:对动脉粥样硬化组(n=9)及对照组(n=9)血浆中miRNAs表达谱进行筛查,采用共表达网络分别对两组样本全体miRNAs的共表达模式进行分析。选取从两组网络中得到的共表达地位差异最为显著的miR-106b-5p进一步研究,通过转染miR-106b-5p mimics上调人脐静脉内皮细胞的miR-106b-5p表达水平,筛查转染后差异基因表达谱,并进一步通过日本京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号转导通路数据库对差异基因富集的信号通路进行分析。结果:动脉粥样硬化组患者血浆中miRNAs的共表达模式(140个节点,1 154条连接线)与对照组(140个节点,612条连接线)相比存在明显差异,在过表达miR-106b-5p后人脐静脉内皮细胞有746个基因水平发生了显著变化(组间差异倍数≥1.5,芯片错误发现率<0.01),主要包括磷脂酰肌醇-3激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又称Akt)信号通路、哺乳动物雷帕霉素受体蛋白(mammalian target of rapamycin,m TOR)信号通路、转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)信号通路、酪氨酸激酶-信号转导及转录激活因子信号通路(janus kinase/signal transducer and activator of transcription,Jak-STAT)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、toll样受体(toll-like receptor,TLR)信号通路、血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)信号通路等20个信号通路。结论:动脉粥样硬化患者血浆中miRNAs共表达模式发生了显著变化,其中共表达地位差异最为显著的miR-106b-5p可靶向调节血管内皮细胞多个信号通路。

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