肿瘤突变负荷检测一致性评价

摘要

目的 使用肿瘤突变负荷(TMB)检测国家参考品,评价基于高通量测序法的肿瘤突变负荷检测试剂盒的TMB检测一致性.方法 使用TMB检测试剂盒(可逆末端终止测序法)检测肿瘤突变负荷检测国家参考品中11对来自肿瘤组织永生化的细胞系和配对白细胞永生化的细胞系.首先将DNA打断,进行末端修复、加接头和PCR扩增等步骤后构建文库;然后将文库杂交捕获;最后使用Next-Seq550 Dx测序仪进行测序.结果 经试剂盒检测,得到TMB-1％、TMB-2％、TMB-5％和TMB-10％的TMB检测国家参考品的Panel-TMB值.22个TMB-5％和TMB-10％参考品的标准TMB值落在试剂盒检测计算的WES-TMB理论值90％预测区间的比例为90.9％(20/22).结论 研制的国家参考品,能够满足肿瘤突变负荷检测试剂盒的TMB检测一致性评价的要求.