环状RNA circ-STK39在肾癌中的表达及可能的调控通路分析

摘要

目的 检测环状RNA circ-STK39在肾癌中的表达,探讨其可能的调控通路.方法 定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)检测31例肾癌及癌旁正常组织中circ-STK39的表达差异;应用RNase R核酸外切酶处理、Sanger测序验证circ-STK39的环化结构及稳定性;绘制接受者操作特征(ROC)曲线初步探讨circ-STK39作为肾癌分子标志物的潜在价值;生物信息学分析circ-STK39的基因特征,并预测其可能的调控通路.结果 qRT-PCR结果显示circ-STK39在肾癌中较癌旁组织的表达显著上调;circ-STK39能耐受RNase R核酸外切酶,表明其环化结构的存在及稳定性;ROC曲线提示circ-STK39对肾癌具有一定的诊断价值,曲线下面积为0.734(95％CI:0.610～0.857),敏感性和特异性分别为0.871和0.516;生物信息学分析显示circ-STK39存在miR-192-5p的潜在结合位点,以此预测并构建了circRNA/miRNA/mRNA调控网络.结论 circ-STK39在肾癌中高表达,其环化结构稳定,circ-STK39可能与miR-192-5p的调控有关.