嗜麦芽寡养单胞菌D2株2套Ⅱ型分泌系统的全基因簇序列测定及分析

摘要

嗜麦芽寡养单胞菌D2株经前期研究发现有2套Ⅱ型分泌系统(T2SS),根据嗜麦芽寡养单胞菌K279a、R551-3、JV3、D457的T2SS基因簇序列,以及D2株的部分测序结果设计引物,采用基因移步法逐一扩增2套T2SS基因序列,产物连接至T载体,经酶切鉴定后测序、拼接.发现有22个完整的开放多码框架(ORF),比对分析后发现T2SS1的基因簇与同种属细菌相应基因簇序列同源性均在80%以上,对应氨基酸序列同源性均能达到97%以上,而T2SS2基因簇与K279a、R551-3对应基因序列和氨基酸序列的同源性均不及T2SS1高.2套T2SS的GspE、F、I基因同源性在50%以上,其他对应基因同源性在35%～68%之间不等,氨基酸序列同源性则为15%～61%.2套T2SS与铜绿假单胞菌PAO1的同源性高于不同科的小肠结肠炎耶尔森菌.T2SS的序列测定及同源性分析为进一步研究细菌蛋白分泌机制奠定基础.