腮腺炎病毒分离株(SP株)SH基因及其旁侧序列的初步分析

摘要

目的比较腮腺炎病毒分离株SP株与其他野毒株的序列差异,以确定其遗传特征.方法将2005年在云南省石屏县收集到的腮腺炎患儿唾液标本,于Vero细胞培养7 d后观察病变并分离收获病毒,用血细胞吸附试验验证.同时提取病毒RNA,采用反转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法从病毒RNA中扩增出SH基因及其旁侧序列,测序并以VectorNTI6.0软件分析.结果 SH基因旁侧区序列分析表明:SP株与国内已知野毒株具有明显的亲缘关系,在SH基因旁侧区范围内的序列一致性为93%～96%,差异均＜8%.氨基酸序列分析发现:该毒株与其他国内野毒株在此区域中的氨基酸序列一致性为93.3%～98.25%,与Wlz2株的遗传距离最近.结论 SP株属于F基因亚型.