生物信息学分析及预测长链非编码RNA MALAT1的分子调控网络

摘要

目的运用在线数据库对长链非编码RNA MALAT1（metastasis—associated lung adenocarcinoma transcript 1，MALAT1）进行生物信息学分析，并进一步推测其分子调控网络。方法运用多个在线数据库，预测并筛选MALAT1的上游转录因子、下游miRNA及其靶基因，筛选出均与其相关的疾病，进一步研究在该疾病中MALAT1的核心调控网络。结果通过预测及筛选，以乳腺癌为研究对象，MALAT1受上游转录因子snail、sox-5、FOXQ1和RUNX1的调控，同时又可调控下游hsa-miR-320a的表达：而hsa-miR-320a的预测靶基因为CCR7、P阿Ⅳ和FADD，它们又可与MALAT1的转录因子相互作用．形成了一个调控环路。结论对MALAT1分子调控网络生物信息学的分析可有助于理解其在乳腺癌发生与发展中的作用机制并为后续实验提供良好的指导依据。