抑制差减杂交法分离玉米幼苗淹水诱导表达基因(英文)

摘要

以淹水处理 (submergence_treated ,ST)的玉米 (ZeamaysL .)幼苗根部cDNA为目标群体 ,未处理 (untreated ,UT)的玉米幼苗根部cDNA为对照群体 ,进行抑制差减杂交。用经过UT差减的STcDNA构建了一个含有大约 2 0 0 0个独立克隆的差减文库。对随机挑取的 40 8个克隆进行差异筛选 ,获得了 1 84个在ST中特异表达或表达增强的候选克隆。对其中 1 55个cDNA克隆测序并去除重复克隆后 ,共得到 95个差异表达的cDNA片段。GenBank中BLAST查询结果表明 :6个克隆为已知的玉米核苷酸序列 ;6 8个克隆与已知基因或EST序列部分区域的同源性为 6 0 %～90 % ;2 1个克隆在GenBank中无法查到对应的同源序列 ,可能代表了新基因 ,或者由于序列位于变异丰富的 3′端而无法查到与其他物种基因的同源性。