蛋白质超二级结构的分类及LOOP序列的统计分析

摘要

本文对6819个相似性小于40%的7个结构类的蛋白质序列进行分析、整理,给出五类超二级结构序列模式α-α、α-β、β-α、β-β hairpin和β-β link共61824个;并根据Loop的长度进一步分类,建立了相应的蛋白质超二级结构数据库,最后对五类超二级结构中loop序列的氨基酸使用进行了统计分析,并与相关工作做了比较.