马铃薯卷叶病毒中国株(PLRV-Ch)ORF2a基因3′端的克隆和序列分析

摘要

用设计合成的一对特异性引物,以马铃薯卷叶病毒中国株PLRV-Ch的RNA为模板,经反转录PCR扩增,将获得的ORF2a的3′端1kbcDNA克隆于pUC19中,构建成重组质粒pLR7,经PCR检测、酶切检测,表明获得了ORF2a的3′端1kbcDNA克隆.从两端进行了两次序列分析,将获得的核苷酸序列与国外报道的四个PLRV分离株的相应区域的同源性进行了比较.结果表明它们具有高度同源性.文中对核苷酸中存在的可能移码序列及其下游的茎环结构(或假节结构),以及上游特征性三次重复序列进行了分析和讨论,发现上游特征性三次重复序列连续排列可形成几个连续的互补双链区和发夹结构,这一结构可能与移码有关.