tRNA丰度是影响蛋白质二级结构形成的一个因素(英文)

摘要

从人和大肠杆菌蛋白质和DNA序列的统计分析,发现mRNA的对应一定蛋白质二级结构的m密码子片段(m=3,4,…,8),当平均tRNA拷贝数高时(对于人高于11,对于大肠杆菌高于2.0),偏好编码螺旋,而避免编码线团;当平均tRNA拷贝数低时,偏好性正好反过来.对于beta折叠,未发现和tRNA拷贝数有明显的统计关联.对大肠杆菌也研究了密码子频数与蛋白质二级结构的相关性,其间的关联比tRNA拷贝数与蛋白质二级结构的关联弱.因此,tRNA拷贝数与蛋白质二级结构的关联可能更为本质.机制目前尚不清楚.一种可能的解释是:tRNA丰度以某种方式影响了新生肽链的折叠,通过翻译精度的因素影响了蛋白质二级结构的形成.