玉米SQD3基因的克隆、生物信息学及表达模式分析

摘要

SQD基因是膜脂中合成硫脂(SQDG)的关键基因,在植物生长发育和光合作用中发挥重要作用。ZmSQD3基因克隆、生物信息学及表达模式分析表明,ZmSQD3基因编码区域中CDS长度为1314 bp,编码437个氨基酸,与ZmSQD3基因亲缘关系最近的是高粱的SQD基因,相似度为92.62%,ZmSQD3基因编码蛋白理论分子量为49.2 kda,等电点为6.85,属不稳定亲水碱性磷酸蛋白,ZmSQD3蛋白被丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化激活从而控制基因的表达,蛋白质二级结构显示Zm SQD3基因编码蛋白中46.00%为α螺旋,14.19%被无规则卷曲占据,β折叠占6.18%,β转角占33.64%。基因表达分析表明,低磷(5μM KH2PO4)胁迫下,无论是根系还是叶片,均呈现出1 d时表达量最低,7 d表达量最高。