基于生物信息学的心梗患者血小板中差异基因筛选及调控网络分析

摘要

目的:构建急性心梗患者外周血血小板中核心miRNA调控网络,探讨外周血血小板相关miRNA在急性心梗的发生、发展中的作用.方法:利用miRNA以及mRNA表达谱芯片筛选出差异表达的miRNA和mRNA,采用FunRich 3.1.3软件预测差异表达miRNA的转录因子及靶基因,而后将预测的靶基因与基因芯片筛出的差异表达的基因取交集,使用Cytoscape软件构建miRNA?mRNA调控网络,并对调控网络中的基因进行KEGG及GO分析.结果:通过基因表达谱数据共筛选到差异表达miRNA 27种,差异表达mRNA 2897个,预测到差异表达miRNA的靶基因共3563个,两者取交集与miRNA交叉匹配后共有503个miRNA?mRNA调控关系,对调控关系中的靶基因进行KEGG富集及GO分析,结果显示这些靶基因主要涉及PI3K?AKT信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调节、MAPK信号通路、人乳头瘤病毒感染、Ras信号通路.GO分析主要分子功能包括蛋白质大分子衔接子活性、分子衔接子活性、DNA结合转录阻遏物活性等.结论:笔者分析了急性心梗人群与非心梗人群外周血血小板中miRNA?mRNA调控网络及功能差异,进一步认识了血小板在急性心梗发生过程中的重要作用,加深了对急性心梗病理机制的理解.