基于网络药理学探讨四逆加人参汤治疗新冠肺炎的作用机制

摘要

目的:基于网络药理学探讨四逆加人参汤治疗新冠肺炎的作用机制.方法:运用中医药系统药理数据库(TCMSP)平台查询四逆加人参汤中化合物成分,设置口服利用度(OB)≥30％,类药性(DL)≥0.18,得到有效化合物.将结果输入Uniprot数据库,统一转换为规范靶点名称.运用GeneCards和OMIM数据库查询COVID-19靶点,得到二者交集靶点,绘制Venn图.运用Cytoscape 3.7.2软件,绘制成分-疾病-靶点网络图.运用相互作用数据库平台String进行靶蛋白互作分析,将数据输入Cytoscape 3.7.2软件进行网络图绘制.运用DAVID数据库对药物-疾病交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.运用Cytoscape 3.7.2软件构建成分-靶点-通路网络图.结果:经筛选得到四逆加人参汤有效活性成分112个,对应234个靶点.经查询筛选得到COVID-19靶点261个,Venn图显示二者交集靶点50个.成分-疾病-靶点网络图中度值较高的化合物为槲皮素、山奈酚、柚皮素、β-谷甾醇.PPI网络分析度值较高的靶蛋白为白细胞介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、TP53、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶3(CASP3).GO富集功能分析显示涉及生物过程341个,细胞组分33个,分子功能50个,涉及炎症反应、细胞对脂多糖的反应、外源性凋亡信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、细胞因子活性、趋化因子活性,血红素结合等生物过程.KEGG信号通路富集功能分析显示共有112条信号通路.包括TNF信号通路、结核、甲型流感、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、Toll样受体信号通路等.成分-靶点-通路网络图显示,四逆加人参汤治疗COVID-19可能主要由槲皮素、山奈酚、柚皮素、β-谷甾醇等活性成分,通过TNF信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路等通路,作用于IL-6、MAPK8、MAPK3、MAPK1、TP53、TNF,CASP3等靶点.结论:四逆加人参汤通过多种活性成分,多靶点、多通路来发挥治疗COVID-19的作用.