KIF2C在肝细胞癌中的作用及ceRNA调控网络构建

摘要

目的:分析驱动蛋白家族成员2C(KIF2C)在肝细胞癌(HCC)中的表达及意义;探索竞争内源性RNA(ceRNA)网络在HCC发展中的潜在作用。方法:利用肿瘤芯片数据库(Oncomine)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析KIF2C在HCC中的表达,及其与HCC的总生存期(OS)、无病生存期(DFS)及病理分级等临床参数的关系;通过RT-qPCR实验分析KIF2C在HCC组织和配对的癌旁组织中的表达;通过细胞功能实验分析干预KIF2C表达对HCC细胞增殖、侵袭与迁移的影响;利用STRING和GeneMANIA数据库探索与KIF2C互作的蛋白和基因;使用高通量测序,寻找log2|FC|>1条件下的差异基因,并进行GO与KEGG富集分析,探索KIF2C潜在的作用通路;通过共表达分析,筛选互作的RNA后构建ceRNA调控网络。结果:KIF2C在HCC中显著高表达(P<0.001);KIF2C表达水平影响HCC患者的生存预后及病理分级(P<0.05);细胞功能实验表明KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭与迁移(P<0.05);有10个蛋白参与KIF2C的蛋白互作;共有20个基因参与KIF2C的基因互作;筛选出3754个长非编码RNA、7621个差异表达信使RNA和170个差异表达微小RNA;GO与KEGG富集分析显示,相关差异基因参与细胞外囊泡、质膜固有成分等功能,且显著富集于p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路;最后,12个lncRNA和5个miRNA构成了一个ceRNA网络,其中has-miR-181b-5p是关键的miRNA。结论:KIF2C在HCC中显著高表达且提示预后不良,KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭和迁移活动;获得与KIF2C相关的ceRNA调控网络,其在HCC中发挥重要作用。