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深纹核桃与防御相关的萜烯合成酶基因鉴定分析

     

摘要

在深纹核桃(Julans sigillata cv.Xixiang)转录组数据中,鉴定萜烯合成酶的基因家族成员,并使用生物信息学方法分析其理化性质、蛋白结构,对不同状态下的表达模式进行分析.深纹核桃萜烯合成酶基因家族中含有65个基因,所含氨基酸176~852个,平均分子质量62228,平均理论等电点值为5.72,除JsTPS6、JsTPS23、JsTPS56分布于叶绿体和细胞质内,其余均定位于叶绿体.转录组测序分析表明,33个JsTPS基因只在茎中表达,11个JsTPS基因只在叶中表达,JsTPS基因家族表达具有组织特异性.JsTPS66、JsTPS24、JsTPS30、JsTPS3、JsTPS31、JsTPS1基因只在环剥处理试验株的叶中高表达,JsTPS10、JsTPS7只在结果老树的茎、叶中表达,JsTPS70同时在环剥植株的茎和结果老树的叶中表达,且前者表达量高于后者.推测JsTPS70可能参与茎条防御相关生理活动,JsTPS66可能参与叶片防御相关生理活动.

著录项

  • 来源
  • 作者单位

    西南林业大学林学院 云南昆明650224;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

    西南林业大学林学院 云南昆明650224;

    云南省林业和草原科学院 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室 云南昆明650201;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 核桃(胡桃);
  • 关键词

    深纹核桃; 转录因子; 萜烯合成酶; 表达分析;

  • 入库时间 2022-08-20 10:57:49

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