甲醛固定石蜡包埋组织STR分型检测

摘要

目的 评估10%甲醛固定石蜡包埋组织STR分型结果 的影响因素.方法 采用QIAGEN法、IO法、Chelex法对2具新鲜尸体在尸检时常规制备的心、脑、肝、脾、肾、肺、胃、肠石蜡包埋组织进行DNA提取,用AmpF STR Identifiler试剂盒进行PCR扩增,在3100-Avant上完成片段分析.另外对15个案例中室温保存1～5年的心、肝、肺、肠存档石蜡包埋组织共56份采用同样的方法 进行STR分型.以STR基因座检出率评估分型有效性.结果 各种组织DNA片段均随着保存时间延长而持续降解,其中心、肺组织STR基因座检出率与保存时间存在线性相关.相同保存时间时,各种组织基因座检出率差异有统计学意义.其中以肺组织在不同保存时间中基因座检出率最高. 结论 在甲醛固定时间一定的条件下,存放时间、组织类型、DNA提取方法 和PCR模板质量浓度是影响石蜡包埋组织STR分型的重要因素.