鲤头长、体厚、体高性状的QTL定位及遗传效应分析

摘要

用174个SSR、41个EST、345个SNP标记对以镜鲤良种后代为祖父母本所培育的杂交F2群体的68个个体进行基因型检测,运用JoinMap 4.0软件包构建遗传连锁图.利用MapQTL 5.O区间作图法(interval mapping,IM)和多QTL区间定位法(MQM mapping,MQM)进行QTL检测,通过置换实验(1 000次重复)确定连锁群显著性水平阈值.在对体高、头长、体厚的区间定位中,共检测到6个与体高性状相关的QTLs区间,分布在LG1(SNP1339-SNP1490)、LG10(HLJE469-SNP1491)、LG12(SNP0922-HLJ1316)、LG13(SNP0937-HLJ328)、LG25(SNP1041-HLJ594)、LG35(SNP1425-SNP0389)等6个连锁群上,解释表型变异范围为20.0%～43.3%.其中,SNP1339-SNP1490区间LOD值最大为3.64,解释表型变异35.4%.6个与头长相关的QTLs,分布在LG1(SNP1339-SNP1490)、LG12(HLJ071-HLJ336)、LG13(SNP0937-HLJ328)、LG24(SNP1359-SNP0586)、LG24(SNP1016-SNP0326)、LG25(HLJ382-HLJ348)等5个连锁群上,其中LG24(SNP1359-SNP0586)解释表型变异达到50.2%.检测到10个与体厚相关的QTLs,分布在LG1、LG8、LC9、LG10、LG12、LG34、LG35、LG38、LG41等9个连锁群上,解释表型变异范围是16.1%-68.8%,其中LG38(HLJ1331-HLJ487)和LG41(HLJ688-HLJE6)解释表型变异分别达到60.8%和68.8%,是体厚性状的主效QTLs区间.