基于生物信息学分析人狼疮肾炎血中相关差异基因

摘要

目的:运用生物信息学筛选人狼疮肾炎血液中相关差异基因,获取潜在狼疮肾炎生物标志物和生物制剂的特异性靶点。方法:从GEO数据库下载基因芯片GSE72747,运用R 3.6.1软件筛选差异表达基因并可视化。运用R软件进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析。借助STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络。结果:筛选到59个差异表达基因,功能主要在Fcγ受体结合和抗原结合上富集。信号通路分析结果显示,差异基因主要在AMPK信号通路和mTOR信号通路上富集。差异基因的PPI网络包含30个节点和54个互作关系。结论:筛选出人狼疮肾炎血液中5个关键基因(EZH2,IGLL5,MS4A1,PAX5,CD38),这些基因既可作为狼疮肾炎早期诊断的生物标志物,也可作为潜在生物制剂的特异性靶点。