利用蛋白质组学筛选肾透明细胞癌肿瘤标志物

摘要

目的：通过蛋白质组学筛选和验证肾透明细胞癌中潜在肿瘤标志物。方法：采用比较蛋白质组学方法筛选正常肾组织和肾细胞癌（renal cell carcinoma，RCC）组织中的差异表达蛋白，通过二维差异凝胶电泳（two-dimensional difference gel electrophoresis，2D-DIGE）和傅里叶变换离子回旋共振质谱（Q-Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry，FT-ICR MS）分离并鉴定16例RCC组织及其相应的正常组织中差异显著的蛋白，并进一步通过实时荧光定量PCR（real-time quantitative PCR，qRT-PCR）、Western印迹和免疫组织化学在RNA和蛋白水平进行验证。结果：通过2D-DIGE共筛选出1 873个蛋白质点，选取68个表达差异大于1.5倍的蛋白质点进行鉴定，成功鉴定出51个蛋白质（P〈0.05），其中16个蛋白表达上调，35个表达下调。采用qRT-PCR和Western印迹验证16例肿瘤和对照组织，结果表明在肿瘤组织中NNMT和Annexin IV表达显著升高，而ACY1和Calbindin显著下调（P〈0.01）。同时针对ACY1和Annexin IV蛋白分别在53例和47例样本中进行免疫组织化学，结果显示相较于对照组织，ACY1在肾透明细胞癌中表达显著降低（P〈0.001），而Annexin IV显著升高（P〈0.001）。结论：ACY1和Annexin IV可作为肾透明细胞癌的肿瘤标志物。