基于ITS2序列白头翁属原植物及药材的DNA条形码鉴定研究

摘要

目的:利用内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对白头翁属基原植物、药材进行DNA分子鉴定,为白头翁属植物的种类鉴定和遗传多样性研究提供理论依据。方法:提取白头翁属植物的DNA,对其ITS2序列进行逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增与测序,且从Gen Bank下载上述所属植物的ITS2序列。所有序列经DNAMAN软件拼接,采用MEGA 6.0软件比对分析以及计算相关数据,基于K2P模型构建Neighbor-Joining(NJ)系统发育树。从ITS2数据库中下载序列的ITS2二级结构信息,比较各样本间ITS2序列二级结构的差异。结果:从NJ系统发育树分析看出,所有样本被聚为3大支。白头翁属植物自成1支,银莲花属植物为1支,獐耳细辛属植物为1支,白头翁属基原植物、药材的ITS2序列完全一致,并与其他混淆药材及植物明显区分。结论:ITS2序列可对白头翁药材、原植物进行鉴别,且在近缘物种鉴定方面具有较大应用价值,可用于白头翁属植物种类的分子鉴定。