基于ITS2基因序列的藏药'达布巴'及其习用品DNA条形码鉴定研究

摘要

为准确鉴别藏药独一味及其混伪品,该研究应用ITS2条形码对43份药材及其混伪品进行鉴定研究.通过对样本进行基因组DNA提取,PCR扩增和双向测序获得ITS2序列.所得序列经CodonCode Aligner拼接后,基于隐马尔可夫模型的HMMer注释方法去除两端5.8S和28S区段,用软件MEGA5.0对序列进行分析比对,并基于K2P模型进行遗传距离分析.采用相似性搜索法、最近距离法、构建NJ树对序列鉴定能力进行评估.结果表明,药材基原物种独一味的ITS2序列种内最大K2P遗传距离均远小于其与混伪品的种间最小K2P遗传距离;应用相似性搜索法分析结果表明ITS2序列可准确鉴定独一味药材及其混伪品;NJ树显示独一味药材与其混伪品可明显区分开,表现出良好的单系性.因此,应用ITS2条形码可稳定、准确地鉴别独一味药材及其混伪品.